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疾病模型

4个人源化DMD小鼠模型携带外显子44、45、51或53缺失,侧翼外显子跳跃可恢复抗肌萎缩蛋白

疾病模型核酸与基因治疗
生成日期:

在mdx背景下构建人DMD外显子44、45、51或53缺失的4个小鼠模型;8周龄雄鼠腓肠肌缺乏或仅有痕量抗肌萎缩蛋白,肌内注射vivo-morpholino跳跃侧翼外显子可恢复蛋白。

机制示意图
  • CRISPR删除双拷贝人DMD YAC上的目标外显子
  • mdx背景下蛋白缺失或仅留痕量
  • 出现变性、再生、炎症与纤维化
  • 跳跃侧翼外显子恢复读框与蛋白

左:染色体5上尾对尾双拷贝人DMD YAC,CRISPR去掉目标外显子;中:mdx背景下肌纤维失去或仅余痕量抗肌萎缩蛋白并出现损伤;右:侧翼外显子被vivo-morpholino跳过后读框恢复、截短蛋白重新出现。示意图由 AI 生成,依据原文结果绘制,非期刊原图,不代表分子比例

研究背景与待解问题

杜氏肌营养不良(DMD)由DMD读框破坏引起。多学科护理下,患者多在十几岁丧失行走、20岁前后需辅助通气,于生命的第二至第四个十年死于呼吸或心力衰竭。位于基因中段、不破坏读框的变异则表现为较轻的Becker型。外显子跳跃与基因编辑都是变异特异的,必须打人源序列。

最常用的mdx小鼠是鼠Dmd第23外显子无义突变,用来验证的是鼠序列。人源hDMD酵母人工染色体(YAC)有完整2.3 Mb人基因,能挽救mdx表型,但整合在小鼠染色体5上、且为尾对尾双拷贝。先前的hDMDdel52/mdx已证明可做临床前工具,再敲别的外显子时,有把两个拷贝3′端一并切掉的风险。van Putten、Aartsma-Rus、Hohenstein等要解决的是:怎样在这套双拷贝YAC上干净地做出患者最常见的单外显子缺失,并证明人源ASO仍能把蛋白救回来。

研究设计

hDMD/mdx携带尾对尾两份人DMD。预筛用两套PCR:一套跨过预期缺失,确认目标外显子已删且3′侧仍在;一套打在缺失内部,把只删掉其中一个拷贝的克隆或动物剔除。del44在先前分离的hDMD/mdx胚胎干细胞中用打内含子43与44的Cas9 RNP完成,经囊胚注射建系。del45、del51、del53直接在合子电转:尽可能用纯合hDMD/mdx雄鼠与C57BL/6J雌鼠,使每个胚胎只带一套尾对尾插入。随后回交到C57BL/6J的mdx,以减少把mdx突变带入所需的回交代数。

跳跃验证在8周龄雄鼠:针对del44跳外显子43、del45跳44、del51跳50、del53跳52。连续两日注射腓肠肌与肱三头肌双侧;最后一次注射后2周取材,同一块肌的冰冻切片同时做RNA与蛋白。

核心结果

双拷贝预筛使四种缺失都能建系

del44胚胎干细胞有14%的候选克隆通过两步预筛;桑格测序只见到一种缺失,提示两个YAC拷贝得到了相同删除。del45同样只见到一种缺失。del51第一轮往往只丢掉一个拷贝,第二套向导打在已缺失区段内,才得到双拷贝都缺外显子51的创始鼠。del53最初是混合测序峰,TOPO克隆12个克隆后拆出两个拷贝上的两种不同缺失。ddPCR显示,除目标外显子缺失外,基因其余抽查外显子仍为两拷贝。

8周龄已出现抗肌萎缩蛋白缺失与mdx样病理

健康hDMD/mdx腓肠肌的人源抗肌萎缩蛋白达野生型水平。hDMDdel44/mdx与hDMDdel53/mdx完全缺失;hDMDdel45/mdx与hDMDdel51/mdx为痕量,免疫荧光上del51几乎看不到阳性。四种缺失模型均出现肌纤维变性与再生、炎症和纤维化,作者认为与mdx/BL6相当。Western每品系上样两个个体,del53用同一只鼠的左右肢。

侧翼外显子跳跃恢复截短蛋白

每品系2或3只雄鼠的左右腓肠肌与肱三头肌,RT-PCR均见到目标外显子跳跃。Western在腓肠肌与肱三头肌检测到截短抗肌萎缩蛋白。作者在讨论中指出,hDMDdel44/mdx跳外显子43后蛋白恢复偏低,可能与缺少43–44的蛋白稳定性较差有关,也可能只是ASO设计未优化;正文未给出恢复百分比。50 μg的43/44跳跃不足以恢复蛋白,故这两条用了100 μg。

机制解读

原文实验证明:在双拷贝人DMD YAC上删除外显子44、45、51或53后,mdx背景下人源抗肌萎缩蛋白消失或只剩痕量,8周龄腓肠肌出现mdx样组织病理。针对侧翼外显子的人源vivo-morpholino可诱导跳跃、恢复读框,并在腓肠肌与肱三头肌重新出现截短蛋白。ddPCR表明目标外显子缺失而其余抽查外显子仍为两拷贝,说明表型不是整段YAC丢失。

作者推测:del45与del51的痕量蛋白来自部分肌纤维的自发跳跃,与临床上适合跳外显子44的患者可见痕量蛋白相一致;这一解释没有在本文用单纤维或测序直接证明。他们也指出,双拷贝YAC对人源蛋白表达量更接近健康对照,但对基因编辑疗法可能低估打靶效率。

局限与不确定

  • 自然病程(运动功能、组织学与分子读出随年龄的变化)作者写明仍在进行,本文只有8周龄雄性、以腓肠肌为主的横断面。
  • 跳跃实验每品系仅2或3只,局部肌内注射,无定量蛋白百分比、无肌力或全身给药数据,也未报告统计学检验。
  • 双拷贝尾对尾整合使基因编辑效率可能被低估;del53两个拷贝的缺失并不相同。
  • mdx背景本身比患者轻;痕量蛋白的自发跳跃假说未闭合。不能把局部概念验证读成临床有效的外显子跳跃方案。

临床/产业意义

加上已有的hDMDdel52/mdx,这四株覆盖患者最常见的单外显子缺失:外显子45(4%)、51(3%)、44(3%)、52(3%)。作者引用文献称,针对这些外显子的单外显子跳跃合计可覆盖超过50%的突变,但精确比例取决于一条缺失能否向前或向后跳。对人源ASO与向导RNA,这些模型的价值是序列匹配,而不是已经完成药效学定量。若要把它们用于基因编辑临床前研究,可能需要先按已发表策略改成单拷贝YAC。

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